1- CONVENIO ENTRE LA ASOCIACIÓN DE UNIVERSIDADES CONFIADAS A LA COMPAÑÍA DE JESÚS EN AMÉRICA LATINA (AUSJAL) Y EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS "SAN FRANCISCO JAVIER" - ISEHF
2- CONVENIO ENTRE LA UNIVERSIDAD CATÓLICA "NUESTRA SEÑORA DE LA ASUNCIÓN" Y LA COMPAÑÍA DE JESÚS - ISEHF. (Desde el 31 de julio de 1987)
3- CONVENIO DE COOPERACION INTERINSTITUCIONAL ENTRE EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS (ISEHF) Y EL MOVIMIENTO DE EUDCACION POPULAR INTEGRAL Y PROMOCION SOCIAL, FE Y ALEGRÍA. Firmado el 05 de marzo del año 2010.
4- CONVENIO MARCO DE COLABORACIÓN INTERINSTITUCIONAL ENTRE LA CORTE SUPREMA DE JUSTICIA Y EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS SAN FRANCISCO JAVIER - ISEHF. Firmado el 27 de agosto del año 2014.
5- CONVENIO DE DOBLE GRADO DE MAGISTER EN GESTIÓN Y DIRECCIÓN EDUCACIONAL ETNRE INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS "SAN FRANCISCO JAVIER" Y LA UNIVERSIDAD ALBERTO HURTADO. Firmado el 20 de enero del año 2016.
6- CONVENIO DE COLABORACIÓN EN EL CAMPO DE LA EDUCACIÓN ENTRE LA UNIVERSIDAD IBEROAMERICANA, A.C. - U.I.A. Y EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS "SAN FRANCISCO JAVIER" - ISEHF. Firmado el 17 de octubre del año 2013.
7- CONVENIO MARCO DE COOPERACIÓN INTERINSTITUCIONAL ENTRE EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS - ISEHF Y LA FACULTAD DE FILOSOFÍA DE LA UNVERSIDAD NACIONAL DE ASUNCIÓN -FFUNA. Firmado el 04 de septiembre del año 2013.
8- CONVENIO DE COLABORACIÓN INTERINSTITUCIONAL ENTRE LA CONGREGACIÓN DE SCHOENSTATT Y EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS "SAN FRANCISCO JAVIER" - ISEHF. Firmado el 25 de julio del año 2006.
9- CONVENIO DE COOPERACIÓN INTERINSTITUCIONAL ENTRE EL MINISTERIO PÚBLICO Y EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS SAN FRANCISCO JAVIER - ISEHF. Firmado el 01 de septiembre del año 2015.
10- CONVENIO MARCO DE COLABORACIÓN INSTERINSTITUCIONAL ENTRE LA ASOCIACIÓN DE MAGISTRADOS JUDICIALES DEL PARAGUAY Y EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS "SAN FRANCISCO JAVIER" - ISEHF. Firmado el 11 de junio del año 2015.
11- CONVENIO AMPLIO DE COOPERACIÓN INTERINSTITUCIONAL ENTRE LE CÍRCULO INTERCULTURAL Y EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS "SAN FRANCISCO JAVIER" - ISEHF. Firmado el 10 de junio del año 2017
12- CONVENIO DE COOPERACIÓN INTERINSTITUCIONAL ENTRE EL CENTRO DE NEGOCIACIÓN, MEDIACIÓN Y FACILITACIÓN “FACILITARTE” Y EL INSTITUTO SUPERIOR DE ESTUDIOS HUMANÍSTICOS Y FILOSÓFICOS “SAN FRANCISCO JAVIER”- ISEHF. Firmado en el año 2014.